Плейотропия усложняет селективный отбор при выведении новых сортов растений. 1 Это явление множественного действия гена, при котором один ген влияет на несколько фенотипических признаков. 2

Например, плейотропный аллель может определять два различных эффекта — один благоприятный, а другой неблагоприятный. 1 Истинная селективная ценность такого аллеля определяется путём сопоставления создаваемых им селективных преимуществ с неблагоприятными селективными эффектами. 1 Как только неблагоприятные эффекты начинают перевешивать преимущества, отбор перестаёт благоприятствовать этому аллелю и начинает действовать против него. 1

Также плейотропия может вызвать проблемы, когда при отборе по одному из признаков лидирует один из аллелей гена, а при отборе по другим признакам — другой аллель этого же гена. 2

Однако при грамотном и целенаправленном использовании плейотропия может быть важна для процесса селекции, например, может помочь в селекции сложных признаков. 5