Пероксисомы влияют на метаболизм жирных кислот, осуществляя β-окисление. 1 На каждом этапе этого процесса алкильная цепь жирной кислоты укорачивается на два атома углерода с высвобождением ацетил-КоА. 1 Далее пероксисомы экспортируют его в цитозоль. 1

Также в пероксисомах происходит α-окисление жирных кислот, которые не могут подвергаться β-окислению из-за наличия метильной группы у β-атома углерода. 1

Кроме того, пероксисомы регулируют окислительно-восстановительное равновесие внутри клетки и концентрацию активных форм кислорода. 5 Количество внутриклеточного пероксида водорода определяет интенсивность морфогенетических и биохимических процессов, а пероксисомы служат регуляторами окислительно-восстановительных реакций, контролирующих скорость как биосинтеза, так и биодеградации. 3