Past Perfect Continuous отличается от других прошедших времён тем, что обозначает действие в прошлом, которое продолжалось в течение какого-то периода в прошлом до другого действия. 1
Например, от Past Continuous оно отличается тем, что в этом времени процесс длился и завершился до другого действия в прошлом, а Past Continuous — процесс длился в момент другого действия, они происходили одновременно. 3
От Past Perfect Past Perfect Continuous отличается тем, что в одном времени важен результат действия и его завершённость, а во втором акцент делается на продолжительности. 4 То есть Past Perfect указывает на результат действия в прошлом, а Past Perfect Continuous — на продолжительность. 1
Также часто в предложении с Past Perfect Continuous есть слова-указатели, подчёркивающие продолжительность, например: for, since, before, until, all day long и т. д.. 1