Парадигма многоуровневой организации материи влияет на классификацию естественных наук следующим образом: она опирается на естественную дифференциацию наук об окружающем мире в зависимости от изучаемого ими уровня организации (строения) материи (её форм и разновидностей) и окружающей природы как главного фундаментального объекта этой науки. 1

В рамках данной парадигмы естественные науки, опираясь на конкретный уровень организации вещественной материи в качестве своего главного фундаментального объекта исследования, получают возможность большей конкретизации предмета своей науки. 5

Например, каждая из традиционных концепций естествознания, опирающаяся на конкретный материальный объект, рассматривается как составная часть единой концепции современного естествознания. 2

Таким образом, парадигма многоуровневой организации материи позволяет более глубоко и системно познавать строение вещества, материи и Мироздания в целом. 1