Формирование Пангеи привело к массовому вымиранию в конце пермского периода, особенно морских видов. 13 По мере образования суперконтинента площадь мелководных мест обитания сокращалась, а суша препятствовала циркуляции холодных полярных вод в тропики. 13 Это привело к снижению уровня кислорода в тёплой воде и сокращению разнообразия морских видов на 95%. 13

Однако распад Пангеи оказал противоположное влияние. 13 По мере увеличения общей протяжённости береговой линии возникло больше мелководных территорий. 13 Это привело к созданию новых сред обитания, так как открылись каналы между частями суши и позволили смешиваться тёплым и холодным океанским водам. 13

На суше распад Пангеи разделил популяции растений и животных, но формы жизни на недавно изолированных континентах со временем приспособились к новой среде обитания, и биоразнообразие увеличилось. 13

Кроме того, Пангея повлияла на климат Земли: внутренняя часть суперконтинента была более прохладной и засушливой, чем по краям, а распад мог способствовать повышению температуры на полюсах, поскольку более холодная вода смешивалась с более тёплой. 1