Палеонтология помогает в изучении экологических взаимодействий древних организмов через палеоэкологию — раздел, изучающий образ жизни и условия существования организмов геологического прошлого и их изменения в процессе развития жизни на Земле. 3

Вот как палеоэкология позволяет реконструировать экологические взаимоотношения древних организмов:

• Изучение скелетных остатков. 1 Морфо-функциональный анализ помогает восстановить образ жизни и условия обитания древних организмов. 1
• Использование геологических данных и литологических характеристик. 1 Это позволяет восстановить обстановку жизни этих организмов и понять причины их гибели. 1
• Анализ условий жизни и гибели древних организмов. 1 Вещественный состав вмещающих пород, их структура, текстурные и геохимические характеристики помогают не только восстановить среду обитания отдельных групп организмов, но и рассмотреть особенности развития их сообществ. 3

Кроме того, палеоэкология даёт ценные сведения для геологии и других наук, например, помогает реконструировать палеографическую обстановку, условия осадконакопления и образования ряда полезных ископаемых. 3