Компартментализация трансляции у эукариот осуществляется следующим образом:

• Трансляция мРНК секреторных и мембранных белков происходит на рибосомах, связанных с гранулярной эндоплазматической сеткой. 13
• По классическим представлениям, ещё 35–45% рибосом связаны с цитоскелетом, а оставшиеся 20–40% рибосом находятся в несвязанном состоянии в цитозоле. 1
• Высказывается гипотеза, что трансляция у эукариот происходит не во всей цитоплазме клетки, а в отдельных областях цитоплазмы, условно называемых «трансляционными компартментами». 3

Кроме того, транскрипция и трансляция осуществляются в отдельных компартментах клетки (ядре и цитоплазме). 4 Предшественники мРНК эукариот должны быть обработаны в ядре, прежде чем они будут экспортированы в цитоплазму для трансляции. 4