Для оптимизации выполнения COUNT(DISTINCT expr) в ClickHouse можно использовать следующие подходы:

• Настройка countdistinctimplementation. 13 Она определяет, какая из функций uniq* используется для выполнения операции. 13 По умолчанию — функция uniqExact. 13
• Настройка optimizefunctionstosubcolumns. 13 При optimizefunctionstosubcolumns = 1 функция читает только подстолбец null вместо чтения всех данных столбца. 1
• Настройка optimizeaggregationin_order. 4 Этот параметр позволяет сэкономить память во время агрегации, но может привести к увеличению времени выполнения запроса. 4
• Настройка maxbytesbeforeexternalgroup_by. 4 Она определяет пороговое значение потребления оперативной памяти, по достижению которого временные данные агрегирования сбрасываются в файловую систему. 4
• Настройка distributedaggregationmemory_efficient. 4 Её можно использовать при распределённой обработке запроса, чтобы снизить количество потребляемой памяти на сервере-инициаторе запроса. 4

Также для оптимизации можно проверить, не используются ли в таблице политики строк, которые требуют фильтрации строк для правильного подсчёта. 2 Ещё одна возможная причина медленного выполнения — использование экспериментальной функции лёгкого удаления. 2