Для оптимизации расположения узлов в большом графе и улучшения его читаемости можно использовать алгоритмы укладки графа. 12

Некоторые из них:

• Fruchterman Reingold. 1 Укладывает узлы по кругу, при этом узлы одного цвета, принадлежащие к одному сообществу, притягиваются друг к другу. 1
• Force Atlas. 1 Если результат укладки устраивает, можно нажать «Стоп». 1
• Расширение (Expand). 1 Если узлы расположены слишком тесно, можно использовать этот инструмент. 1
• Укладка меток. 1 После включения меток они могут наползать друг на друга. 1 Чтобы этого избежать, можно запустить специальный алгоритм. 1

Для работы с графами и их визуализацией можно использовать специальные программы, например Gephi. 1

При оптимизации расположения узлов в графе важно учитывать эстетические критерии, такие как минимизация пересечений рёбер, площади изображения, изгибов рёбер и другие. 2 При этом оптимизировать все критерии сразу невозможно, так как они обычно противоречат друг другу. 2