Формирование четырёх фенотипических классов потомков в отношении 9:3:3:1 при скрещивании гибридов, различающихся по двум парам признаков, можно объяснить с помощью закона независимого наследования: 2

• Если оба родителя гетерогенны по обоим признакам. 1 Один признак является доминантным, а другой — рецессивным. 1 Из 16 возможных потомков только один будет иметь оба рецессивных гена. 1

• Девять будут иметь по крайней мере один ген для обоих доминирующих генов. 1 При наличии одного или нескольких генов для доминирующего гена фенотип будет показывать оба доминирующих фенотипа. 1

• Три возможных потомства будут иметь двойной рецессив для одного признака, следовательно, этот рецессивный признак будет выражен, в то время как другой признак будет доминирующей формой. 1

• Три других потомства будут иметь двойной рецессив по другому признаку. 1 Отсюда и соотношение фенотипов 9:3:3:1. 1