Образование природных карбонатов в почве происходит при трансформации (растворении) литогенных карбонатов (реликтовые морские известняки). 2 При этом они обмениваются углеродом с CO2, полученным из биологических источников (разложение органических веществ и корневое дыхание), и переосаждаются как CaCO3 в почве. 2

Образование природных карбонатов в горных породах происходит в результате биологической, химической или механической аккумуляции, главным образом из воды. 5

Биогенные карбонатные породы (в основном биоморфные известняки) возникают путём осаждения известковых скелетных остатков планктонных и нектонных организмов, а также биохемогенным путём (химическое осаждение карбоната кальция и доломита вокруг водоросли или внутриклеточно за счёт пересыщения воды CO2). 5

Хемогенные карбонатные породы (микрокристаллические доломиты, магнезиты, известняки) образуются в тиховодной обстановке в озёрных, морских, лагунных, океанических бассейнах при осаждении под действием силы тяжести микроскопических кристаллов карбонатных минералов, выделяющихся из пересыщенных ионных растворов. 5

Механогенные карбонатные породы с обломочной структурой возникают в процессе накопления и последующей цементации обломков различных карбонатолитов. 5