Нуклеоид в бактериальной клетке образуется и организуется следующим образом:

Нуклеоид — зона неправильной формы в цитоплазме клетки, в которой находится геномная ДНК и ассоциированные с ней белки. 3 На долю ДНК приходится около 60% массы нуклеоида; помимо ДНК, нуклеоид содержит РНК и белки. 3

В большинстве случаев геном бактерии представлен кольцевой молекулой ДНК, которую также называют хромосомой. 3 Как правило, бактериальная хромосома имеет длину около 1 мм, она занимает до 20% цитоплазмы и имеет объём около 0,2 мкм³. 3

Организация нуклеоида осуществляется с участием различных белков, связанных с ним. 2 К числу наиболее важных из них относятся топоизомеразы. 2 Они контролируют суперспирализацию ДНК, которая играет важную роль в её компактизации, и обеспечивают протекание таких процессов, как репликация и транскрипция, для которых требуется раскручивание молекулы ДНК. 2

Хотя нуклеоид обладает аморфной структурой, отдельные гены располагаются в нём упорядоченно. 2 Положение генов в нуклеоиде отражает их относительное расположение на карте хромосомы. 2