Образ Апофиса повлиял на современную массовую культуру следующим образом:

• В поп-культуре он часто появляется как символ зла или хаоса. 1 Например, на образе Апофиса основан один из персонажей научно-фантастического телесериала «Звёздные врата: SG-1», выступающий как второй главный враг Земли после Ра. 2 Также Апофис — антагонист в книгах серии «Наследники богов» Рика Риордана: «Огненный трон» и «Тень Змея». 2 Ещё он присутствует в голливудской ленте «Боги Египта». 2
• В честь Апофиса назван астероид (99942) Апофис, опасно сближающийся с Землёй. 29 Название оказалось особенно удачным, так как существует потенциальная угроза столкновения этого астероида с Землёй. 2

В астрономии образ Апофиса также нашёл отражение: в 2004 году американские астрономы открыли астероид, который назвали в честь древнеегипетского бога — огромного змея-разрушителя из подземного мира, намеренного уничтожить Солнце. 3