Комплексы генов могут влиять на проявление признака у организма следующим образом:

• Комплементарность. 14 Для проявления определённого состояния признака необходимо присутствие как минимум двух доминантных аллелей разных пар. 1 Например, у тыквы при скрещивании растений со сферическими и длинными плодами в первом поколении появляются растения с дисковидными плодами. 1
• Эпистаз. 14 Один неаллельный ген подавляет развитие признака другого. 1 Например, у кур окраска оперения определяется одним доминантным геном, тогда как другой доминантный ген подавляет развитие окраски, в результате чего большинство кур имеет белое оперение. 1
• Полимерия. 14 Неаллельные гены оказывают одинаковое влияние на развитие признака. 1 Таким образом чаще всего кодируются количественные признаки. 1 Например, цвет кожи человека определяется как минимум четырьмя парами неаллельных генов — чем больше доминантных аллелей в генотипе, тем темнее кожа. 1

Кроме того, гены взаимодействуют друг с другом и, оказавшись в одном генотипе, могут сильно влиять на проявление действия соседних генов. 1