Мюон влияет на физические процессы в природе следующим образом:

• Проникает сквозь обычную материю. 3 Мюоны могут проникать на десятки метров в горные породы и другие вещества, прежде чем ослабнуть в результате поглощения или отклонения другими атомами. 3
• Участвует в химических реакциях. 1 Положительный мюон в обычной материи может связать электрон и сформировать мюоний — атом, в котором мюон становится ядром. 1 Этот короткоживущий атом в первом приближении ведёт себя в химических реакциях как сверхлёгкий изотоп водорода. 1
• Используется в мюонной томографии. 25 Если поставить мюонные детекторы над и под некоторым объектом, можно по разнице интенсивности мюонов сделать выводы относительно его внутренней структуры. 2