Морфологические особенности бактерий влияют на их способность к окраске по методу Грама через различие в строении клеточной стенки. 34
У грамположительных бактерий она толстая, но однослойная, содержит много пептидогликана — муреина, а также тейховые кислоты. 4 Эти вещества образуют прочное соединение с красителями — генцианвиолетом и йодом и поэтому остаются окрашенными после обработки мазка спиртом. 4 Таким образом, грамположительные бактерии по методу Грама окрашиваются в сине-фиолетовый цвет. 4
У грамотрицательных бактерий клеточная стенка тонкая, но двухслойная. 4 Муреина мало, причём он содержится во внутреннем слое клеточной стенки, тейхоевые кислоты отсутствуют. 4 Внешний слой клеточной стенки содержит, главным образом, вещества, обладающие гидрофобными свойствами — липополисахариды и липопротеиды. 4 Эти вещества не образуют прочного комплекса с красками генцианвиолетом и йодом и поэтому клетки обесцвечиваются после обработки 96% этиловым спиртом и после дополнительной окраски красителем фуксином окрашиваются в бледно-розовый цвет. 4