Молекулярное моделирование используется для изучения белков, чтобы понять их структуру и динамику. 1

Некоторые способы применения:

• Построение моделей пространственных структур. 1 Для этого используется гомология с аминокислотными последовательностями родственных белков, для которых пространственная структура известна. 1
• Изучение конформационной подвижности. 1 Для этого применяется метод молекулярной динамики, который позволяет получить представление о свойственных изучаемому белку конформационных переходах. 1
• Анализ экспериментальных данных. 1 Исследование трёхмерных моделей белков с помощью методов молекулярного моделирования, таких как молекулярная динамика и докинг лигандов, помогает эффективнее анализировать данные. 1
• Компьютерный дизайн точечных мутаций. 1
• Выдвижение гипотез. 1 Молекулярное моделирование позволяет объяснять имеющиеся факты и выдвигать обоснованные гипотезы для экспериментальной проверки. 3

Знание структуры белка необходимо для разработки новых лекарственных препаратов, современных вакцин, выбора антигенов для диагностических систем и других задач. 3