Микроорганизмы влияют на формирование окислительно-восстановительных градиентов в окружающей среде следующим образом: в процессе жизнедеятельности они могут изменять окислительно-восстановительный потенциал среды, выделяя в неё различные продукты обмена. 5

Например, окисление сульфида до серной кислоты тионовыми бактериями, нитрификация и многие виды брожения вызывают подкисление среды. 2 К подщелачиванию среды приводит дезаминирование белков и аминокислот аммонификаторами, разложение мочевины уробактериями, а также фотоассимиляция СО2. 2

Также микроорганизмы влияют на концентрацию кислорода в природных местообитаниях. 3 При наличии в среде окисляемых субстратов и прежде всего органического вещества кислород быстро потребляется аэробами и поэтому в условиях ограниченного обмена с атмосферой быстро становится лимитирующим фактором. 3