Мезодерма влияет на формирование осевых органов у хордовых следующим образом:

• Из хорды, которая формируется из мезодермы, развивается хрящевой и костный скелет. 1
• Из боковых участков мезодермы образуются мышцы, кровеносные сосуды, сердце, почки, органы половой системы, надпочечники и половые железы. 1

Кроме того, мезодерма обеспечивает билатеральную симметрию тела, метамерность его строения (сегментацию) и формирование органов и тканей. 3

Например, внутренний участок сомита (склеротом), имеющий вид рыхлой мезенхимы, развивается в хрящевую и костную ткани осевого скелета. 5 Размножаясь, клетки склеротома заполняют пространство, окружающее хорду, покрывают её и становятся источником развития хрящевых тел и дуг позвонков. 5