Методы термодинамического анализа применяются в разработке молекулярных инструментов на основе олигонуклеотидов для прогнозирования их поведения. fizmathim.com www.dissercat.com
Некоторые способы использования:
- Определение термодинамических параметров формирования олигонуклеотидных комплексов. fizmathim.com Для этого применяют, например, метод термической денатурации, который позволяет регистрировать кривые плавления комплексов на нескольких длинах волн. fizmathim.com
- Оценка энергетических эффектов от образования ДНК-комплексов. fizmathim.com Для этого используют методы, такие как анализ вкладов от введения в структуру дуплекса модифицирующих остатков, метод множественной линейной регрессии и метод поиска решения. fizmathim.com
- Выбор оптимальных олигонуклеотидных мишеней. bmcbioinformatics.biomedcentral.com Для этого применяют процедуры термодинамической фильтрации, которые позволяют выбрать олигонуклеотиды, способные эффективно взаимодействовать с мишенями гибридизации. bmcbioinformatics.biomedcentral.com
Таким образом, точное термодинамическое описание ДНК-комплексов помогает выявлять энергетические вклады от формирования отдельных элементов структуры ДНК-компонентов и составлять алгоритмы прогностического расчёта гибридизационных свойств олигонуклеотидных конструкций. fizmathim.com