Как метод молекулярной динамики применяется в биофизике и структурной биологии?

Метод молекулярной динамики (МД) в биофизике и структурной биологии применяется для изучения движений макромолекул, таких как белки и нуклеиновые кислоты. en.wikipedia.org Это позволяет:

• уточнить трёхмерные структуры белков и других макромолекул на основе экспериментальных данных рентгеновской кристаллографии или ЯМР-спектроскопии; en.wikipedia.org
• интерпретировать результаты определённых биофизических экспериментов; en.wikipedia.org
• смоделировать взаимодействия с другими молекулами, например, при стыковке лигандов. en.wikipedia.org

Также МД помогает:

• Прогнозировать структуру белка путём моделирования сворачивания полипептидной цепи из случайного витка. en.wikipedia.org
• Симулировать биомембраны (двойной липидный слой в водном растворе). kib.nsu.ru Это позволяет моделировать процессы проникновения малых молекул через мембрану, взаимодействие мембран с мембранными белками и формирование трансмембранных каналов, которые обеспечивают обмен внутриклеточного вещества с окружающей средой. kib.nsu.ru

Ещё МД используется для компьютерного конструирования биотехнологических катализаторов и лекарственных препаратов. dl.libcats.org