Метод хроматографии используется для разделения растительных пигментов на основе различий в скорости движения пигментов в растворителе (подвижной фазы по неподвижной фазе). 1

Принцип метода состоит в том, что молекулы хлорофилла разного размера и разной окраски при пропитывании бумаги или слоя мела в стеклянной трубке перемещаются под воздействием растворителя с разной скоростью. 2

Например, при тонкослойной хроматографии на бумаге на полоске бумаги чертят горизонтальную линию старта на расстоянии 4 см от края. 2 Из ранее приготовленной вытяжки берут стеклянной палочкой или капилляром небольшую порцию экстракта и переносят её многократно на стартовую линию хроматографической бумаги в виде полоски или пятна диаметром не более 1 см. 2 Бумагу подсушивают на воздухе, и нанесение повторяют 5–6 раз, чтобы сконцентрировать пигмент и не допустить образования большого пятна. 2

Далее в сосуд или цилиндр с растворителем (например, бензином) на дне опускают хроматограмму стартовой линией вниз, так, чтобы бумага слегка касалась растворителя, и плотно закрывают пробкой. 2 Сосуд должен быть насыщен растворителем, который, поднимаясь вверх по хроматографической бумаге, увлекает за собой смесь пигментов. 2

По окончании разделения пигментов хроматограмму вынимают, сразу же отмечают границу подъёма растворителя. 2 В результате пигменты распределяются в следующем порядке: первым снизу адсорбируется хлорофилл b жёлто-зелёного цвета, затем сине-зелёная зона хлорофилла а, выше ксантофилл, каротин очень быстро движется и располагается вверху полоски хроматографической бумаги у фронта растворителя. 2