Метилированные основания защищают ДНК от расщепления за счёт системы рестрикции-модификации. 12 Она помогает бактериям отличить свою ДНК от чужеродной по паттерну метилирования. 1

Чужеродная ДНК, попав в бактерию, расщепляется рестриктазами (специальными ферментами, разрезающими ДНК в определённых участках). 2 Однако те же самые последовательности собственной ДНК бактерии защищены от расщепления метильными метками. 2

Также метилирование подавляет распространение вирусных генов, тандемных повторов (бессмысленных последовательностей ДНК) и транспозонов. 2 Больше всего таких модификаций наблюдается в некодирующих районах ДНК. 2

У млекопитающих, в частности человека, метилирование повторяющихся участков играет важную роль в стабилизации ДНК. 2 Если повторяющиеся участки деметилируются (теряют метильные метки), они становятся мутагенными и вызывают геномную нестабильность — хромосомные аномалии, каскад апоптозных реакций, онкотрансформацию клетки. 2