Метаболизм фотоавтотрофов и хемоавтотрофов различается способом получения энергии. 14

Фотоавтотрофы используют энергию света для восстановления углекислого газа до органических соединений. 12 К этой группе относятся растения и некоторые группы бактерий, прежде всего цианобактерии. 1

Хемоавтотрофы используют для своей жизнедеятельности энергию, выделяющуюся при окислении неорганических веществ. 12 Представителями этой группы являются только бактерии. 1 Каждый вид таких бактерий способен использовать только один источник энергии, при этом используемые ими вещества должны в достаточных количествах присутствовать в окружающей среде. 1

Таким образом, основное различие заключается в том, что фотоавтотрофы используют световую энергию, а хемоавтотрофы — энергию химических реакций окисления неорганических соединений. 3