Значение слова «пень» в русском языке менялось, в частности, в зависимости от контекста и употребления.

В древнерусском языке одним из значений слова «пень» был «ствол дерева». 5 В диалектах пнём называли не только оставшуюся на корню часть ствола, но и нижнюю часть живого дерева, от корневища (комля) до первых сучьев. 35

В современном языке слово «пень» имеет два значения: 1

1. Прямое — оставшаяся на корню часть ствола спиленного, срубленного или сломанного дерева. 13
2. Переносное — глупый, бестолковый или бесчувственный человек (разговорное, сниженное). 1

Таким образом, значение слова «пень» расширилось и стало включать не только часть дерева, но и абстрактное понятие о человеке.