После образования водородных связей структура белка меняется следующим образом: белковая нить закручивается в виде спирали, что формирует вторичную структуру белка. 23

Чаще всего водородные связи возникают внутри одной полипептидной цепи между близко расположенными остатками аминокислот, что приводит к закручиванию этой цепи в так называемую α-спираль. 3 Каждый виток спирали связан со следующим витком спирали несколькими водородными связями, что придаёт структуре значительную прочность. 1

Также образование водородных связей между пептидными группами соседних полипептидных фрагментов цепей приводит к формированию β-структуры, или складчатого слоя. 1 В отличие от α-спирали, складчатый слой имеет зигзагообразную форму, похожую на гармошку. 1