Магнитное склонение влияет на навигацию в море и в воздухе следующим образом:

В море магнитное склонение позволяет по известным магнитным направлениям получить истинные. 2 Для этого на навигационных картах указывают значение магнитного склонения в районе плавания, а также год, к которому оно отнесено, и значение его годового изменения. 2 В процессе плавания магнитное склонение необходимо приводить к году плавания: к указанному на карте значению прибавляют или вычитают годовое изменение склонения, умноженное на разность лет между годом фактического плавания и годом, к которому относится склонение на карте. 2

В воздухе магнитное склонение помогает переходить от одной системы отсчёта к другой. 3 Если измерять одно и то же направление от истинного или магнитного меридиана, их численные выражения будут различными и отличаться на величину магнитного склонения. 3 Пилот и штурман должны безошибочно уметь переходить от одной системы отсчёта к другой. 3

Также в районах магнитных аномалий, где магнитное склонение резко отличается от его среднего значения для данного района моря или океана, показания магнитного компаса ненадёжны. 2