Люпин негативно влияет на биологическое разнообразие природных сообществ. 15

Образуя сплошные заросли, люпин вытесняет аборигенные виды растений, лишая их доступа к солнечному свету. 1 Среди вытесненных видов могут встречаться редкие и находящиеся под угрозой исчезновения. 1

Благодаря азотфиксирующим клубенькам на корнях растения люпина изменяют состав почвы в пользу видов, требовательных к азоту. 1 Прежде всего это касается луговых фитоценозов: под влиянием люпина луговые растения, предпочитающие относительно бедные почвы, выпадают из состава сообществ и заменяются нитрофильными (любящими азот) растениями. 1

Также люпин способен лишить местных насекомых привычной кормовой базы и тем самым повлиять на состав их популяций. 1