Лизогения влияет на промышленность и медицину следующим образом:

В промышленности лизогения может приводить к экономическим убыткам из-за фаголизиса промышленных культур. 2 Для коммерчески ценных штаммов микроорганизмов существуют генно-инженерные системы защиты, направленные на предотвращение этого процесса. 2

В медицине лизогения позволяет использовать бактериофаги для диагностики, профилактики и лечения инфекционных заболеваний. 1 Бактериофаги применяют для установления источника инфекции, путей передачи возбудителя, для выявления определённых видов бактерий во внешней среде, при проведении генно-инженерных исследований. 1

Кроме того, дефектные фаги, которые образуются при лизогении, используют как векторы в генной инженерии. 4