Компьютерные системы повлияли на развитие нумерической таксономии в микробиологии следующим образом:

• Позволили интегрировать морфологические, физиологические, биохимические и молекулярно-генетические признаки микроорганизма в рамках единого и пригодного для компьютерной обработки описания. 2 Для этого признаки представляют в форме компьютерной программы, записанной на специальном языке программирования. 12
• Дали возможность использовать для построения таксономических деревьев всю доступную информацию об организме. 2 В качестве метрики расстояния применяют параметр, включающий алгоритмическую сложность. 2
• Позволили включать знания и личный опыт систематика в процесс выбора и кодирования признаков. 1 Программа-описание способствует более обдуманному подходу и сохраняет логику принятых решений для последующего анализа другими исследователями. 1

Благодаря нумерическому принципу была усовершенствована таксономия бактерий родов Bacillus, Mycobacterium, Vibrio. 3 Базы данных, созданные для применения нумерической таксономии, ценны как богатые источники информации фенотипических признаков бактерий, что используется бактериологами для идентификации микроорганизмов. 3