Клеточная оболочка бактерий влияет на проницаемость следующим образом:

• У грамположительных бактерий обработка спиртом вызывает разбухание муреина и уменьшение диаметра пор клеточной стенки, что в целом приводит к снижению её проницаемости. 1 Так как грамположительные бактерии характеризуются высоким содержанием муреина, то в результате обработки спиртом их стенки становятся почти непроницаемыми для красителей. 1
• У грамотрицательных бактерий слой муреина тонкий и не играет существенной роли в проницаемости стенки. 1 Однако у них есть дополнительная наружная мембрана, которая является дополнительным барьером, препятствующим проникновению в клетку крупных молекул. 13
• Клеточная стенка грамположительных бактерий с простой структурой более проницаема для ряда антибиотиков, чем грамотрицательная клеточная стенка. 5