Кинетопласт связан с функционированием митохондрий тем, что содержит ДНК, необходимую для работы этих органелл. 12

Кинетопласт содержит ДНК в двух формах: миникольца и максикольца. 1 Максикольца кодируют белки, необходимые для функционирования гигантской митохондрии, в которой находится кинетопласт. 1 Функция миниколец заключается в регуляции экспрессии максиколец путём образования направляющих РНК. 1

Кроме того, кинетопласт обычно находится вблизи базального тельца жгутика, поэтому, вероятно, прочно связан с цитоскелетом. 14

Также от кинетопласта в цитоплазму отходят выросты, соответствующие митохондриям. 5