Химический состав гидросферы в кайнозойскую эру изменялся по следующим причинам:

• Появление фотосинтезирующих организмов. 1 Их деятельность привела к поступлению в Мировой океан кислорода, который тратился на окисление железа и его осаждение на океаническом дне. 1 В результате принципиально изменился солевой состав океанических вод. 1

• Вынос минеральных веществ из рифтовых зон Земли в океаны. 3 После полного насыщения океанической коры водой и некоторого подъёма поверхности океана из рифтовых зон в океаны стали в изобилии выноситься минеральные компоненты. 3

• Развитие оледенения в четвертичном периоде. 5 Оно стимулировало как вертикальную, так и горизонтальную океанскую циркуляцию, что выразилось в увеличении биологической продуктивности ряда океанских областей. 5

• Периодические изменения солёности. 5 В связи с многократным оледенением Европы изменения солёности повторялись неоднократно. 5

• Нарушение экологического равновесия в органическом мире океана. 5 Изменялись положения фронтов, влиявших на биопродуктивность морских экосистем. 5 В первую очередь происходило преобразование абиотических компонентов — освещённости и температуры верхнего слоя океана, количества кислорода, углекислого газа и питательных веществ (фосфор, азот, кремний). 5