В последние тысячелетия фауна Балтийского моря претерпевала следующие изменения: 1

1. В период Иольдиевого моря (11700–10700 лет назад) присутствовали морские водоросли, ракушковые и двустворчатые моллюски. 1 В северной и восточной частях моря распространялась кольчатая нерпа. 1 В прибрежных областях господствовали хвойные леса. 1
2. В период Анцилового озера (10700–8500 лет назад) в результате быстрого таяния ледника и поднятия суши Иольдиевое море утратило связь с океаном. 1 Вновь наступила стадия пресноводного озера. 1 В начальной фазе развития озера в прибрежной зоне доминировали сосновые и берёзовые леса. 1
3. В период Литоринового моря (8500–4000 лет назад) повышение солёности в сочетании с тёплым климатом способствовали значительному росту продуктивности и разнообразия жизни Балтийского моря. 1 На стадии Литоринового моря в Балтику проникают серый и обыкновенный тюлени, а также представитель китообразных — морская свинья. 1
4. Около 4000 лет назад, когда береговая линия, режим солёности и другие параметры моря стали близки к современным, начинается новая, постлиториновая стадия. 1 Придонная солёность снизилась до 12%, исчез брюхоногий моллюск, а появился моллюск двустволка Макома балтика. 1 Поэтому Балтику иногда называют морем Макомы. 1

В голоцене серьёзных изменений во флоре и фауне Балтийского моря не произошло, лишь ареалы растений и животных сдвигались в направлении север-юг, в соответствии с изменениями климата. 2