В процессе образования воды в митохондриях окислительно-восстановительный потенциал изменяется, когда электрон быстро перемещается с CuA-центра на гем a. 12
Это приводит к тому, что молекулы воды в канале D переориентируются, делая его открытым для протона. 12
В результате на внутренней мембране митохондрий образуется протонный градиент (мембранный потенциал): 5