В последние десятилетия наблюдается сокращение численности чернозобой гагары в разных регионах Европы. 1

Некоторые факты об изменениях численности:

• За последние 40–70 лет южная граница ареала чернозобой гагары в пределах Европы сдвинулась к северу на 200–300 км. 4
• Чернозобая гагара исчезла из Рязанской, Московской и Ярославской областей. 4
• В Белоруссии южная граница гнездовой части ареала гагары заметно отступила к северу. 1
• В Латвии и Эстонии исчезли многие ранее известные поселения вида. 1

Центрально-европейская популяция чернозобой гагары включена в Красную книгу России (2001) как неуклонно сокращающая свою численность. 3

Основным фактором снижения численности и сокращения ареала чернозобой гагары называют опасность, которую представляет для птиц человек. 2 Этот вид сохраняется лишь там, где фактор беспокойства снижен до минимума, то есть в самых глухих малонаселённых местах, либо на особо охраняемых природных территориях. 2