Активность генов изменяется в разных фазах клеточного цикла следующим образом:

• В G1-фазе активизируется синтез РНК для роста клеток и увеличения органелл. 4 Комплекс Cdk—циклин (G1—CDK) фосфорилирует факторы транскрипции, необходимые для активации экспрессии генов, ответственных за образование синтетического комплекса S-CDK. 3
• В S-фазе осуществляется синтез ДНК (репликация) белков хроматина с последующим удвоением хромосом. 4
• В G2-фазе происходит подготовка к делению: продолжается синтез РНК и белка, при этом синтезируются долгоживущие РНК, обеспечивающие синтез белков в дочерних клетках сразу после деления. 4
• Во время митоза транскрипция подавляется на 100%, трансляция — более чем на 90%. 5

Также на активность генов влияют структурные перестройки ДНК (инсерции), которые могут приводить к активации или инактивации гена. 4