С развитием электронных библиотек структура аннотаций изменилась следующим образом:

• В семантических электронных библиотеках для аннотирования публикуемых ресурсов используются специально разработанные онтологии. 1 В результате для каждого ресурса создаётся семантическое метаописание, состоящее из набора триплетов, в состав которых могут входить контекстные и контентные семантические метаданные. 1 Контекстные метаданные представляют собой утверждения о связи объекта с другими объектами и понятиями онтологий, а контентные — утверждения о знаниях, содержащихся в самом объекте. 1

• В развитых электронных библиотеках объектами аннотирования могут быть не только фрагменты текстовых документов или документы в целом, но и связи между ними. 3 Аннотации сами могут представляться в виде связей между аннотатором (автором аннотации) и аннотируемым целевым объектом. 3

Кроме того, структура аннотации может включать четыре блока: идентификационный, тематический (содержательный), сервисный и хронологический. 4 В зависимости от цели аннотирования определяется структура аннотации и варьируются её объём и состав аспектов содержания. 4