Современная классификация по кладам изменилась по сравнению с «догенетической» классификацией по царствам и классам следующим образом:

• Отказ от термина «царство». 4 Некоторые классификации, основанные на современной кладистике, отказались от него, так как некоторые традиционные царства не являются монофилетическими, то есть не состоят из всех потомков общего предка. 4
• Упорядочивание таксонов в эволюционное дерево. 7 Этим занимается направление систематики «кладистика» (или филогенетическая систематика). 7 В основу классификации кладётся кладограмма — схема взаимоотношений таксонов. 7
• Пересмотр систематики малоизвестных групп организмов. 10 Это происходит по мере поступления новых молекулярных данных. 10

Таким образом, современная классификация стремится уйти от модели «надцарство-царство-тип(отдел)-класс» и перейти к модели «Группа А-группа B — группа С», особенно для высоких рангов таксонов (включая царство). 10