Классификация млекопитающих изменилась с момента создания современной системы таксонов, что связано с развитием молекулярной филогенетики. 13 Она позволила выявить родственные отношения между отдельными отрядами, включающими ныне живущие виды. 1

Некоторые изменения в классификации млекопитающих:

• Деление плацентарных на четыре большие группы. 1 В соответствии с результатами большинства молекулярных исследований, все плацентарные сейчас классифицируют на Afrotheria (афротерии), Xenarthra (неполнозубые), Euarchontoglires (эуархонтоглиры) и Laurasiatheria (лавразиатерии). 1
• Сближение китообразных с архаичными парнокопытными. 3
• Более дробное деление некоторых отрядов. 3 Например, сумчатых, которых ранее объединяли в один отряд, теперь делят на 5–7 отрядов. 3 На несколько отрядов делят насекомоядных, неполнозухих, однопроходных. 3
• Исключение из классификации некоторых отрядов. 3 Так случилось с ластоногими, разные семейства которых в настоящее время группируют с наиболее близкородственными им семействами наземных хищных. 3

С развитием геносистематики филогенетические отношения многих групп пересматриваются, поэтому число таксонов современных млекопитающих по разным классификациям сильно варьирует. 4 Всего насчитывается до 30 отрядов, 129 семейств и 4650 видов. 4