Чтобы избежать конфликтов между системными пакетами и пользовательскими приложениями на Python, рекомендуется:

• Использовать виртуальные окружения. 13 Они создают собственные каталоги директории, изолированные от глобальной системы Python, что позволяет управлять зависимостями отдельно для каждой задачи. 1
• Документировать зависимости. 1 Для этого нужно создавать файл requirements.txt, который содержит список всех необходимых библиотек и их версий. 3
• Обновлять пакеты с осторожностью. 1 Перед обновлением зависимостей следует проверять совместимость новых версий с проектом. 3
• Удалять неиспользуемые пакеты. 1 Периодически нужно проверять список установленных данных и удалять ненужные пакеты. 1
• Следить за версиями. 1 Для проверки информации о пакете можно использовать инструмент pip show. 1

Также для автоматизации управления зависимостями можно использовать инструменты, такие как pip-tools или poetry. 3