Исследования ископаемых останков хордовых животных повлияли на современные представления об их происхождении следующим образом:

Палеонтологическая летопись позволила установить родство между классами животных. 2 Например, найденные остатки пернатых нептичьих динозавров свидетельствуют о происхождении птиц от первых. 2

Изучение особенностей организмов в различные геологические эпохи дало возможность изучать, как они менялись в процессе эволюции. 3 На основе этих данных можно уточнить филогенетические древа и привязать определённые виды к определённым эпохам. 3

Анализ летописи окаменелостей показал, что планы тела формировались постепенно, в течение миллионов лет, а не внезапными всплесками неснижаемой сложности. 4