Изоэлектрическая точка используется для разделения белков в изоэлектрическом фокусировании путём создания системы с градиентом рН. 5
Для каждого белка существует такое значение рН среды (изоэлектрическая точка, pI), при котором положительные и отрицательные заряды ионизированных групп скомпенсированы, и заряд всей белковой молекулы равен нулю. 1
В процессе изоэлектрического фокусирования белки, движущиеся в электрическом поле, достигают области, где значение рН равно их изоэлектрической точке. 5 При этом значении суммарный заряд белка равен 0, и он не способен перемещаться в электрическом поле. 5
Когда белки достигают этой области, заряд их нейтрализуется, и миграция прекращается. 34 В результате белки образуют чёткие полосы, и каждый белок располагается в градиенте значений рН в соответствии со своей изоэлектрической точкой. 2