Использование минеральных удобрений влияет на почвенные микроорганизмы как прямым образом (за счёт изменения содержания легкодоступных питательных веществ), так и косвенным (из-за изменения pH, повышения продуктивности растений и поступления в почву органических веществ). 1

Некоторые эффекты воздействия минеральных удобрений на микроорганизмы:

• Снижение микробной биомассы. 1 Особенно заметно на необрабатываемых землях и при непродолжительном применении. 1
• Изменение видового состава. 3 Увеличивается численность бактерий, способных усваивать минеральные формы азота, но уменьшается число симбионтных микрогрибов в ризосфере растений. 3
• Уменьшение количества азотфиксирующих бактерий. 3 В результате корневая система растений уменьшает выделение органических соединений, и фотосинтез растений снижается. 3
• Активация токсинообразующих микрогрибов. 3 Их численность в естественных условиях контролируется полезными микроорганизмами. 3

Однако есть и положительные эффекты: долговременное внесение минеральных удобрений на сельскохозяйственных землях с низким естественным плодородием и при возделывании культур с большим количеством растительных остатков может приводить к повышению биомассы и активности почвенных микроорганизмов. 1

Таким образом, влияние минеральных удобрений на микроорганизмы зависит от многих факторов и может быть как положительным, так и отрицательным.