Ископаемые остатки диатомовых водорослей помогают учёным изучать древние климатические условия следующим образом:

• По ископаемым комплексам диатомей можно реконструировать палеогеографическую обстановку прошлых геологических эпох. 1 Это возможно, если в них присутствуют виды, дожившие до наших дней. 1
• Диатомовые водоросли служат индикаторами климатических изменений. 5 Они чутко отзываются на изменения химического состава, освещённости, температуры и даже размеров озонового слоя атмосферы. 5 Например, при похолодании существенно снижается количество диатомей, вместо одних видов появляются другие. 5
• Анализ количественных соотношений тепловодных и холодноводных видов помогает оценить палеотемпературы фотической зоны вод. 2
• О древних климатических условиях можно судить и по происходившим в прошлом перемещениям границы лесов. 1 Хвойные деревья могут влиять на структуру озёрных сообществ диатомей: вода, проходя через слои опавшей хвои, окрашивается органическими веществами, в результате чего условия обитания водорослей меняются. 1