Инфузории-туфельки используются в научных исследованиях как модельные организмы. 2 С их помощью изучают, например:

• Влияние различных химических веществ на количество и поведение инфузорий. 2 Это позволяет лучше понять их экологическую роль. 2
• Механизмы питания, движения и размножения инфузорий. 5 Такие исследования могут привести к новым открытиям и разработке методов лечения и биотехнологических процессов. 5
• Безопасность почвы, природных и сточных вод. 14 Инфузории способны различать в воде небольшие доли растворённых солей и кислот, а также тяжёлые металлы и ядовитые вещества. 1
• Токсичность кормов, лекарств, полимерных материалов и питьевой воды. 14

В образовательных целях инфузории-туфельки используются для изучения простейших. 2 Это позволяет ученикам наглядно знакомиться с жизненным циклом и поведением микроорганизмов. 2

Также инфузории-туфельки могут применяться как средство биологической очистки в аквариуме и в природе, поскольку они питаются низшими бактериями и считаются естественными природными санитарами. 1