Индекс Жаккара в биологии и экологии применяется для анализа видового состава сообществ или проб. 4 С его помощью определяют степень сходства биоценозов, оценивают сосуществование видов, биологическое разнообразие и экосистемы. 3

Например, с помощью этого индекса можно рассчитать индекс сходства двух растительных сообществ (фитоценозов) и выявить виды, которые исчезли или появились в результате антропогенного воздействия и рекреационной нагрузки. 2

Также индекс Жаккара используется в других областях биологической науки, где наблюдаются и сравниваются бинарные данные: 3

• В биохимии. 3 Когда молекулы и реакции представлены в виде хэшированных отпечатков пальцев, с помощью индекса Жаккара проводят количественные сравнения и классификации. 3
• В геномике. 3 С его помощью оценивают геномные интервалы в двух выборках или группах, чтобы проверить, является ли их перекрытие статистически значимым, что свидетельствует об общих геномных вариациях. 3