Хроматиды связаны с рекомбинацией ДНК через процесс гомологичной рекомбинации. 14

Суть процесса в том, что повреждённый участок одной молекулы ДНК заменяется его неповреждённой копией, взятой из другой (гомологичной) молекулы ДНК. 1 Для этого нужно объединить попарно гомологичные молекулы ДНК, чтобы использовать неповреждённые участки одной молекулы в качестве «матрицы» для исправления повреждений в другой молекуле. 1

Сестринские хроматиды являются идеальным шаблоном для гомологичной рекомбинации, поскольку они являются идентичной копией данной хромосомы. 4 Это происходит во время и вскоре после репликации ДНК, в фазах S и G2 клеточного цикла, когда сестринские хроматиды более легкодоступны. 4