Для хранения водных беспозвоночных используют разные виды аквариумов в зависимости от размера и особенностей обитателей. 1

Для крупных беспозвоночных применяют стандартные аквариумы небольшого размера. 1 Для мелких форм — микроаквариумы, стеклянные или пластиковые сосуды различной формы. 1 Некоторые группы водных беспозвоночных (трубочники, листоногие раки и другие) лучше всего сохраняются в широких плоских ёмкостях, например кюветах или чашках Петри. 1

Некоторые особенности хранения беспозвоночных в аквариумах:

• Циркуляция воды должна поддерживать обитателей в подвешенном состоянии. 2 Вода должна вращаться со средней скоростью: слишком быстрое течение может повредить уязвимые тела, а слишком медленное — привести к образованию мёртвых зон. 2
• В аквариуме с медузами не должно быть аэрации. 2 Даже самые мелкие пузырьки воздуха могут пробить тело беспозвоночных. 2 Лучше всего проводить аэрацию в отдельной части резервуара и оградить её, например, с помощью губок, чтобы воздух не попадал в основную часть аквариума. 2
• Температура в аквариуме обязательно должна быть стабильной. 2
• Освещение зависит от наличия симбионтов (мелких специфических водорослей). 2 Если они есть, освещение делают ярким, если симбионтов нет, то можно ограничиться слабой искусственной подсветкой. 2

Транспортировка водных беспозвоночных, например медуз, осуществляется очень аккуратно. 2 Их перевозят в резервуарах со сглаженными углами или в полиэтиленовых пакетах достаточно большого объёма. 2 Из ёмкости или пакета необходимо удалить весь воздух. 2 При этом животных нельзя доставать из воды даже при упаковке или окончательном помещении в аквариум. 2