Хламидомонада влияет на цвет пресноводных водоёмов следующим образом: при активном размножении она может окрашивать воду в зеленоватый цвет. 2
Также хламидомонада вместе с другими водорослями вызывает цветение воды, которое говорит о высокой степени загрязнённости водоёма. 3